「熊本にもYWCAを作りませんか」との呼びかけがあり、東京で学生YWCA活動を行い、江藤ゆきを中心に14名の委員で一年間の準備の後、発足した。

1964年11月8日　熊本YWCA創立（出席者47名）全国で21番目の創立であった。　難民支援（1981年～82年）や水俣病問題（1984年）、「原爆の図」協力開催（1985年）、「広島、沖縄から平和を考える集い」開催（1985年）などを経て、人権や平和の問題に取り組んできた。また、様々な国から来る留学生の現状を鑑み、　「留学生問題を考える会」発足（1988年）翌年、名称を「留学生と共に歩む会」変更（1989年）4月から国際部「留学生の会」として日本語教室、日本人家族紹介、談話室、ひな祭り、英会話、英文学クラスなどを開始した。

1991年　留学生のためのリサイクルセンター建設。現在に至る。

　　　　 日本語ボランティア養成講座を開始（毎月50名参加）

1992年　日本語ボランティア派遣　（黒髪小学校・桜山中学校）

1993年　朗読劇「この子たちの夏」上映会

1994年　国際隣人会（インターナショナル・ネイバーズ）開始　

　　　　 外国人妻の会と連帯して、住民票記載問題に取り組み開始

1995年　阪神大震災　支援物資・義援金送付・ボランティア派遣

2001年　PDYYY発足（ユースのユースによるユースのためのパートナーシップ開発）（ユース会員19名）

2003年　子ども買春反対ワークショップ

2004年　熊本YWCA創立40周年記念第1回『原爆遺構の旅』アメリカオハイオ州デイトンで長崎原爆投下機見学、アメリカ市民との学習・交流を図る旅

2011年　東北大震災復興支援活動、被災者支援セカンドハウス提供活動

2013年　熊本YWCA50周年記念礼拝　石井摩耶子日本Y理事長　　姜尚中氏講演会「ミナマタ」「フクシマ」そしていのち

2015年　東北大震災復興支援活動　「福島&熊本キッズ春のわくわくキャンプ」第1回開始

2017年　Cosmopolitan委員会発足

2018年　10月ビジョン合宿　熊本YWCA将来計画づくり「私たちのスランプラリー　2035年ビジョン」コミュニティーカフェ活動の開始を決める。

2019年　10月ぷれはぶCafé　スタート

2020年　1月NPO法人認可　「NPO法人熊本YWCA」

　　　　 4月なかよしクラブ開始

　　　 　7月熊本南部豪雨災害発生　　被災者支援活動開始　

2021年　4月　米米クラブ～米作りと人吉支援～開始